Flora faraj , mikrobiota faraj atau mikrobiom faraj ialah mikroorganisma yang menjajah faraj. Ini ditemui oleh Albert Döderlein seorang pakar dari Jerman pada tahun 1892.[1] dan merupakan sebahagian daripada keseluruhan flora pada manusia. Jumlah dan jenis bakteria yang ada mempunyai implikasi yang ketara terhadap kesihatan keseluruhan individu.[2] Bakteria utama yang menjajah individu yang sihat adalah daripada genus Lactobacillus,[3] seperti L. crispatus, dan asid laktik yang dihasilkannya dianggap melindungi daripada jangkitan oleh spesies patogen.[4]